Como adicionar animação para plotly figura em Python

Question 1

Atualmente tenho este código:

fig= go.Figure()
for idx in range(len(reference)):
    df = reference.loc[idx]
    if df.ObjClass != 0:
        x,y = df.Polygon.exterior.xy
        fig.add_trace(go.Scatter(x=np.array(x), y=np.array(y)))
return fig

O enredo é para boudning caixas usando polígonos. Moste a probabilidade de não ser o mais eficiente, aberto para melhorias de lá também.

A minha pergunta é como adicionar uma animação e existente Plotly figura? Na minha df eu tenho uma coluna de tempo que seria adequado para que (df).O tempo). Quando a animação é adicionado, eu só quero desenhar os polígonos para que o carimbo de data / hora.

Desenho sem animação

EDIT: a Adição de Dados struct

Portanto, este não funciona quando desenhar, como eu explico no meu comentário abaixo. No entanto, se eu mudar para a classificação por ObjID em vez de Tempo, ela não funciona, mas a animação quadro não é classificado. Eu quero o menor tempo para ser o primeiro e mais alto no final.

ObjClass    Time    ObjID   Corner  Lat Long
0   3.0 5.9 54.0    RR  21.549906   129.418088
563 3.0 5.9 54.0    LR  23.569243   129.523022
1126    3.0 5.9 54.0    LF  23.569243   136.523022
1689    3.0 5.9 54.0    RF  21.549906   136.418088
1   3.0 5.95    54.0    RR  17.946687   114.856340
564 3.0 5.95    54.0    LR  19.726662   114.919184
1127    3.0 5.95    54.0    LF  19.726662   121.919184
1690    3.0 5.95    54.0    RF  17.946687   121.856340
2   3.0 6.0 54.0    RR  17.685873   121.115523
565 3.0 6.0 54.0    LR  19.556310   121.182149
1128    3.0 6.0 54.0    LF  19.556310   128.182149
1691    3.0 6.0 54.0    RF  17.685873   128.115523
3   3.0 6.05    54.0    RR  17.685873   121.115523
566 3.0 6.05    54.0    LR  19.556310   121.182149
1129    3.0 6.05    54.0    LF  19.556310   128.182149
1692    3.0 6.05    54.0    RF  17.685873   128.115523
4   3.0 6.1 54.0    RR  17.375609   127.925362
567 3.0 6.1 54.0    LR  19.322351   127.848100
1130    3.0 6.1 54.0    LF  19.322351   134.848100
1693    3.0 6.1 54.0    RF  17.375609   134.925362

Question 2

Você não forneceu dados de exemplo. Implicitamente está definido um quadro de dados

Polígono	ObjClass	horário
POLÍGONO ((58 91, 58 77, 0 73, -0 87, 58 91))	1	00:00
POLÍGONO ((51 102, 58 90, 7 62, 0 74, 51 102))	1	01:00
POLÍGONO ((40 110, 52 101, 18 54, 6 63, 40 110))	1	02:00

Este tem assumido uma coluna adicional ObjectId que é o mesmo polígono que tem coordenadas diferentes para cada tempo

Maneira mais simples de criar um plotly animado figura é usar Plotly Express. Portanto, reestruturar os dados sejam x e y elementos de um longo dataframe

import io
import pandas as pd
import numpy as np
import plotly.graph_objects as go
import plotly.express as px
import shapely.wkt


df_p = pd.read_csv(io.StringIO("""Polygon,ObjectId,ObjClass,time
"POLYGON ((58 91, 58 77, 0 73, -0 87, 58 91))",0,1,00:00
"POLYGON ((51 102, 58 90, 7 62, 0 74, 51 102))",0,1,01:00
"POLYGON ((40 110, 52 101, 18 54, 6 63, 40 110))",0,1,02:00
"POLYGON ((28 112, 41 109, 30 52, 17 55, 28 112))",0,1,03:00
"POLYGON ((32 29, 20 33, 38 93, 50 89, 32 29))",1,1,00:00
"POLYGON ((45 31, 34 29, 25 91, 36 93, 45 31))",1,1,01:00
"POLYGON ((57 38, 47 32, 13 84, 23 90, 57 38))",1,1,02:00
"POLYGON ((65 50, 58 39, 5 72, 12 83, 65 50))",1,1,03:00
"POLYGON ((1 90, 7 90, 12 48, 6 48, 1 90))",2,1,00:00
"POLYGON ((-7 85, -2 89, 20 53, 15 49, -7 85))",2,1,01:00
"POLYGON ((-13 78, -10 83, 26 60, 23 55, -13 78))",2,1,02:00
"POLYGON ((-15 69, -14 75, 28 69, 27 63, -15 69))",2,1,03:00
"POLYGON ((59 12, 49 18, 84 92, 94 86, 59 12))",3,1,00:00
"POLYGON ((77 11, 65 11, 66 93, 78 93, 77 11))",3,1,01:00
"POLYGON ((94 17, 83 12, 49 87, 60 92, 94 17))",3,1,02:00
"POLYGON ((107 30, 99 21, 36 74, 44 83, 107 30))",3,1,03:00
"POLYGON ((9 29, 3 37, 13 43, 19 35, 9 29))",4,1,00:00
"POLYGON ((12 28, 4 34, 10 44, 18 38, 12 28))",4,1,01:00
"POLYGON ((15 29, 5 31, 7 43, 17 41, 15 29))",4,1,02:00
"POLYGON ((17 32, 8 29, 5 40, 14 43, 17 32))",4,1,03:00"""))

df_p["Polygon"] = df_p["Polygon"].apply(shapely.wkt.loads)

# explode out ploygons to x & y for plotly express
df_plot = (
    df_p["Polygon"]
    .apply(
        lambda p: [{"x": x, "y": y} for x, y in zip(p.exterior.xy[0], p.exterior.xy[1])]
    )
    .explode()
    .apply(pd.Series)
    .join(df_p)
)


px.line(df_plot, x="x", y="y", color="ObjectId", animation_frame="time")

usando dados de exemplo

dados de exemplo não está usando bem torneadas https://shapely.readthedocs.io/en/stable/manual.html#polygons Portanto, use de exterior.xy no código de exemplo é irrelevante
dados de exemplo define dados como uma seqüência de valores para um ObjID , onde um dos vértices é qualificado com o Canto
para desenhar um polígono, uma sequência de x/y, que inclui o mesmo ponto no início e no final é necessário. Este foi inserido
a ordem é importante, portanto, definir o Canto como https://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/reference/api/pandas.Categorical.html
em seguida, é simples de usar, plotly para gerar uma animação figura

import pandas as pd
import io
import plotly.express as px

df = pd.read_csv(
    io.StringIO(
        """ObjClass    Time    ObjID   Corner  Lat Long
0   3.0 5.9 54.0    RR  21.549906   129.418088
563 3.0 5.9 54.0    LR  23.569243   129.523022
1126    3.0 5.9 54.0    LF  23.569243   136.523022
1689    3.0 5.9 54.0    RF  21.549906   136.418088
1   3.0 5.95    54.0    RR  17.946687   114.856340
564 3.0 5.95    54.0    LR  19.726662   114.919184
1127    3.0 5.95    54.0    LF  19.726662   121.919184
1690    3.0 5.95    54.0    RF  17.946687   121.856340
2   3.0 6.0 54.0    RR  17.685873   121.115523
565 3.0 6.0 54.0    LR  19.556310   121.182149
1128    3.0 6.0 54.0    LF  19.556310   128.182149
1691    3.0 6.0 54.0    RF  17.685873   128.115523
3   3.0 6.05    54.0    RR  17.685873   121.115523
566 3.0 6.05    54.0    LR  19.556310   121.182149
1129    3.0 6.05    54.0    LF  19.556310   128.182149
1692    3.0 6.05    54.0    RF  17.685873   128.115523
4   3.0 6.1 54.0    RR  17.375609   127.925362
567 3.0 6.1 54.0    LR  19.322351   127.848100
1130    3.0 6.1 54.0    LF  19.322351   134.848100
1693    3.0 6.1 54.0    RF  17.375609   134.925362"""
    ),
    sep="\s+",
    engine="python",
)

# if polygon is a quadrangle, need five points to define it. 4 is just a linestring
# duplicate first corner
df = pd.concat([df, df.loc[df["Corner"].eq("RR")].assign(Corner="RR2")])

# need to sort by Corner, hence make it a categorical
df["Corner"] = pd.Categorical(
    df["Corner"], ["RR", "RF", "LF", "LR", "RR2"], ordered=True
)

px.line(
    df.sort_values(["ObjID", "Time", "Corner"]),
    x="Long",
    y="Lat",
    color="ObjID",
    animation_frame="Time",
).update_layout(
    xaxis={"range": [df["Long"].min(), df["Long"].max()]},
    yaxis={"range": [df["Lat"].min(), df["Lat"].max()]},
)

Rob Raymond · Answer 1 · 2021-12-03T15:41:12

Você não forneceu dados de exemplo. Implicitamente está definido um quadro de dados

Polígono	ObjClass	horário
POLÍGONO ((58 91, 58 77, 0 73, -0 87, 58 91))	1	00:00
POLÍGONO ((51 102, 58 90, 7 62, 0 74, 51 102))	1	01:00
POLÍGONO ((40 110, 52 101, 18 54, 6 63, 40 110))	1	02:00

Este tem assumido uma coluna adicional ObjectId que é o mesmo polígono que tem coordenadas diferentes para cada tempo

Maneira mais simples de criar um plotly animado figura é usar Plotly Express. Portanto, reestruturar os dados sejam x e y elementos de um longo dataframe

import io
import pandas as pd
import numpy as np
import plotly.graph_objects as go
import plotly.express as px
import shapely.wkt


df_p = pd.read_csv(io.StringIO("""Polygon,ObjectId,ObjClass,time
"POLYGON ((58 91, 58 77, 0 73, -0 87, 58 91))",0,1,00:00
"POLYGON ((51 102, 58 90, 7 62, 0 74, 51 102))",0,1,01:00
"POLYGON ((40 110, 52 101, 18 54, 6 63, 40 110))",0,1,02:00
"POLYGON ((28 112, 41 109, 30 52, 17 55, 28 112))",0,1,03:00
"POLYGON ((32 29, 20 33, 38 93, 50 89, 32 29))",1,1,00:00
"POLYGON ((45 31, 34 29, 25 91, 36 93, 45 31))",1,1,01:00
"POLYGON ((57 38, 47 32, 13 84, 23 90, 57 38))",1,1,02:00
"POLYGON ((65 50, 58 39, 5 72, 12 83, 65 50))",1,1,03:00
"POLYGON ((1 90, 7 90, 12 48, 6 48, 1 90))",2,1,00:00
"POLYGON ((-7 85, -2 89, 20 53, 15 49, -7 85))",2,1,01:00
"POLYGON ((-13 78, -10 83, 26 60, 23 55, -13 78))",2,1,02:00
"POLYGON ((-15 69, -14 75, 28 69, 27 63, -15 69))",2,1,03:00
"POLYGON ((59 12, 49 18, 84 92, 94 86, 59 12))",3,1,00:00
"POLYGON ((77 11, 65 11, 66 93, 78 93, 77 11))",3,1,01:00
"POLYGON ((94 17, 83 12, 49 87, 60 92, 94 17))",3,1,02:00
"POLYGON ((107 30, 99 21, 36 74, 44 83, 107 30))",3,1,03:00
"POLYGON ((9 29, 3 37, 13 43, 19 35, 9 29))",4,1,00:00
"POLYGON ((12 28, 4 34, 10 44, 18 38, 12 28))",4,1,01:00
"POLYGON ((15 29, 5 31, 7 43, 17 41, 15 29))",4,1,02:00
"POLYGON ((17 32, 8 29, 5 40, 14 43, 17 32))",4,1,03:00"""))

df_p["Polygon"] = df_p["Polygon"].apply(shapely.wkt.loads)

# explode out ploygons to x & y for plotly express
df_plot = (
    df_p["Polygon"]
    .apply(
        lambda p: [{"x": x, "y": y} for x, y in zip(p.exterior.xy[0], p.exterior.xy[1])]
    )
    .explode()
    .apply(pd.Series)
    .join(df_p)
)


px.line(df_plot, x="x", y="y", color="ObjectId", animation_frame="time")

usando dados de exemplo

dados de exemplo não está usando bem torneadas https://shapely.readthedocs.io/en/stable/manual.html#polygons Portanto, use de exterior.xy no código de exemplo é irrelevante
dados de exemplo define dados como uma seqüência de valores para um ObjID , onde um dos vértices é qualificado com o Canto
para desenhar um polígono, uma sequência de x/y, que inclui o mesmo ponto no início e no final é necessário. Este foi inserido
a ordem é importante, portanto, definir o Canto como https://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/reference/api/pandas.Categorical.html
em seguida, é simples de usar, plotly para gerar uma animação figura

import pandas as pd
import io
import plotly.express as px

df = pd.read_csv(
    io.StringIO(
        """ObjClass    Time    ObjID   Corner  Lat Long
0   3.0 5.9 54.0    RR  21.549906   129.418088
563 3.0 5.9 54.0    LR  23.569243   129.523022
1126    3.0 5.9 54.0    LF  23.569243   136.523022
1689    3.0 5.9 54.0    RF  21.549906   136.418088
1   3.0 5.95    54.0    RR  17.946687   114.856340
564 3.0 5.95    54.0    LR  19.726662   114.919184
1127    3.0 5.95    54.0    LF  19.726662   121.919184
1690    3.0 5.95    54.0    RF  17.946687   121.856340
2   3.0 6.0 54.0    RR  17.685873   121.115523
565 3.0 6.0 54.0    LR  19.556310   121.182149
1128    3.0 6.0 54.0    LF  19.556310   128.182149
1691    3.0 6.0 54.0    RF  17.685873   128.115523
3   3.0 6.05    54.0    RR  17.685873   121.115523
566 3.0 6.05    54.0    LR  19.556310   121.182149
1129    3.0 6.05    54.0    LF  19.556310   128.182149
1692    3.0 6.05    54.0    RF  17.685873   128.115523
4   3.0 6.1 54.0    RR  17.375609   127.925362
567 3.0 6.1 54.0    LR  19.322351   127.848100
1130    3.0 6.1 54.0    LF  19.322351   134.848100
1693    3.0 6.1 54.0    RF  17.375609   134.925362"""
    ),
    sep="\s+",
    engine="python",
)

# if polygon is a quadrangle, need five points to define it. 4 is just a linestring
# duplicate first corner
df = pd.concat([df, df.loc[df["Corner"].eq("RR")].assign(Corner="RR2")])

# need to sort by Corner, hence make it a categorical
df["Corner"] = pd.Categorical(
    df["Corner"], ["RR", "RF", "LF", "LR", "RR2"], ordered=True
)

px.line(
    df.sort_values(["ObjID", "Time", "Corner"]),
    x="Long",
    y="Lat",
    color="ObjID",
    animation_frame="Time",
).update_layout(
    xaxis={"range": [df["Long"].min(), df["Long"].max()]},
    yaxis={"range": [df["Lat"].min(), df["Lat"].max()]},
)

Muito obrigado por sua resposta! Ajuda med muito! No entanto, agora eu tenho um novo problema. Usando o seu exemplo, eu reestruturei meu dataframe para um formato longo com "Lat" e "Longo" colunas. No entanto, parece muito exigente em como me classificar meus dados. Se eu ordenar por "ObjID" é trabalho, mas o cronograma está todo bagunçado. Se eu ordenar por "Tempo" em vez disso, a linha do tempo é OK, mas então ele plota apenas um dos objetos por valor de tempo, apesar de existirem várias.
você não tem partilhado a sua estrutura de dados, então eu tinha para inferir. Parece que você tem um quadro de dados com polígonos onde cada polígono tem um ObjId que é constante ao longo do tempo / transformações. daí que como eu estruturada de dados de exemplo. a atualização de sua pergunta head(10) de seu dataframe e eu vou atualizar. É por isso que todos TÃO orientações sobre como fazer perguntas de estresse necessidade de compartilhar dados de exemplo. Não é coisa horrível de compartilhamento de dados como uma imagem forçar o respondente para uso não-confiável OCR para usá-lo
Adicionado a minha estrutura de dados acima. Parece um pouco mal, mas eu espero que você pode copiá-lo sem muito trabalho.
atualizado responder - lhe completamente a surpreender-me com o código de exemplo usando bem torneadas. Parece que o seu exemplo de código e dados de amostra não estão relacionados
Hehe que é porque eu mudei meu bem Torneadas Polígono abordagem para ficar mais próximo a sua resposta. Os dados originais não incluem objetos de Polígono, mas deixei aqueles ao tentar adaptar minha df para o seu exemplo.
ok - eu acho que deixando como polígonos é melhor... que vai apoiar 3,4,5, etc lados de polígonos. a chave é classificá-lo antes de explodir ele

Como adicionar animação para plotly figura em Python

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usando dados de exemplo

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